持有少于本金的股份并不构成损失。基金持有份额按照基金净值计算。例如，投资者购买了价值1万元的基金产品，认购费为0，认购日基金份额净值为1.0200，则认购份额=10000/1.0200=9803.92，此时投资者的持股比例将低于投资本金。

持有股份少于本金是正常的。每个基金份额代表基金的净值。基金的净值在不断变化，其总价值也在不断变化。基金总资产=基金净值份额。即使持有的股份少于本金，也不能认为意味着亏损，持有的股份与投资的盈亏无关。

基金持股与本金不同的原因：

1、认购基金需收取手续费。如果直接从金额中扣除认购费，认购款就会减少。同一基金产品分为A类和C类。A类需要基金认购费，直接从认购资金中扣除，所以认购费与基金市值之和就是本金。

2、基金市值的不断变化导致基金资产也不断变化。因为基金也会随时间发生变化，如果股价持续变化，基金的持股份额不会发生变化，但基金的净值会发生变化，从而投资者持有的基金资产也会发生变化。

3、若基金产品净值大于1，则基金持有份额将小于申购金额。